Королевство Камелот погружено в хаос. Чародейство и волшебство сеют смуту среди людей. Пришедший к власти Утер Пендрагон запрещает колдовство под страхом смерти, изгоняет волшебников, убивает всех драконов, оставляя в назидание лишь одного. Через 20 лет в Камелот прибывает Мерлин, уроженец маленькой деревушки, рождённый с волшебными способностями. Он становится помощником придворного лекаря, Гаюса, который помогает ему найти предназначение его даров.

Игра ведется с последней серии 4-го сезона.

Артур вернул себе престол, после того как Моргана чуть не разрушила его королевство. Девушке пришлось бежать в лес, но к счастью или к сожалению её ранил один из рыцарей Артура, поэтому она не смогла долго быть в сознании. И все же девушка выжила, с помощью белого дракона, которого пробудил Мерлин.
Теперь моргана стала еще злее. Ненависть к Артуру растет в ней с каждым днем, так же как и страх перед Эмрисом. Злая колдунья создала новое королевство, которое находилось неподалеку от Камелота. Сначала это были руины, но магия, способна сделать из груды камней прекрасную резиденцию. Позже она начала призывать всех волшебников, которые разбрелись по свету. А в особенности тех, которые пострадали от рук Утера и "Великого очищения". Намереваясь отомстить Камелоту и его королю, она собирает армию. Армию злых магов, которые несомненно хотят мести, такой же как и сама Моргана.